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Estimación Automática del Coste de Comunicación de Aplicaciones Paralelas en Plataformas Heterogéneas

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2018
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Universidad Extremadura
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Resumen
Optimizar el tiempo de ejecución de aplicaciones paralelas en plataformas heterogéneas de altas prestaciones es un problema complejo. Estas aplicaciones cient´ıficas normalmente se componen de kernels que implementan algoritmos como la multiplicación de matrices, ecuaciones en derivadas parciales o Transformadas de Fourier. Los kernels son ejecutados por los procesos desplegados en los diferentes recursos de cómputo de una plataforma, por ejemplo, en procesadores multi-core o aceleradores (GPUs, Xeon PHIs, etc.). El volumen de datos del kernel se distribuye entre los procesos de forma proporcional a su capacidad de cómputo, de forma que se equilibra la carga computacional global. Este equilibrado de carga no homogéneo tiene un impacto importante en el coste de las comunicaciones. La optimización del coste de las comunicaciones de éstas aplicaciones se aborda habitualmente mediante pruebas exhaustivas en la plataforma destino. Sin embargo, estas pruebas consumen recursos y tiempo, y a menudo se basan en la extrapolación de los resultados obtenidos con la ejecución de una versión reducida de la aplicación en la plataforma. Los Modelos Anal´ıticos de Rendimiento de Comunicaciones ofrecen una alternativa factible y prometedora en este sentido. Estos modelos representan el coste de las comunicaciones de un kernel en una plataforma heterogénea, ofreciendo una estimación precisa de su tiempo de comunicación de forma no invasiva, esto es, sin utilizar recursos de cómputo HPC en la estimación. Este trabajo contribuye ofreciendo una herramienta de estimación que permite representar y evaluar expresiones de coste de comunicaciones que siguen el modelo t- Lop. Adem´as, permite incluir el c´alculo de coste de las comunicaciones de forma autom´atica en algoritmos de particionamiento y optimización de comunicaciones. En este documento se proporcionan ejemplos tanto de uso b´asico como avanzado. Se incluyen tres casos de ejemplo de modelado de comunicaciones en kernels representativos utilizando la herramienta: la solución de una ecuación diferencial utilizando la técnica de elementos finitos, un algoritmo paralelo de multiplicación de matrices densas, y una simulación N-Body. Estos kernels utilizan diferentes patrones de comunicación y particionamiento del espacio de datos.
Descripción
Actas Jornadas Sarteco 2018, Universidad Extremadura, (231-240 páginas)
Categorías UNESCO
Palabras clave
Modelos de Rendimiento de Comunicación, Análisis de Rendimiento, Modelos de Rendimiento Funcional, Plataformas Heterogéneas
Citación
Sergio Moreno-Álvarez, Juan Antonio Rico-Gallego, Juan Carlos Dı́az-Martı́in. "Estimación Automática del Coste de Comunicación de Aplicaciones Paralelas en Plataformas Heterogéneas". Actas Jornadas Sarteco 2018, Universidad Extremadura, (231-240 páginas)
Centro
Facultades y escuelas::E.T.S. de Ingeniería Informática
Departamento
Lenguajes y Sistemas Informáticos
Grupo de investigación
Grupo de innovación
Programa de doctorado
Cátedra
DOI